Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 AL513477.2-201ENST00000607858 568 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 AL354821.1-201ENST00000617598 809 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 AFTPH-205ENST00000422803 1525 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 KARSP3-201ENST00000571212 1504 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 AL355379.1-201ENST00000405542 640 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 ARL2BPP10-201ENST00000446487 531 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 LMOD2-201ENST00000456238 918 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 LINC01181-201ENST00000503718 556 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 TMEM191C-213ENST00000545656 574 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
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ATP1A4Q13733 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
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ATP1A4Q13733 DTNA-232ENST00000599844 853 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 TEX41-238ENST00000604253 709 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
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ATP1A4Q13733 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
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ATP1A4Q13733 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
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ATP1A4Q13733 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 AC135352.1-201ENST00000506173 1418 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 KC6-201ENST00000592302 1713 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 GLS-204ENST00000409428 816 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 AL133480.1-201ENST00000411561 638 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
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