Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

Predictions only

Length 750 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 UBA52P3-201ENST00000491303 382 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 LINC00616-203ENST00000512536 568 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 LINC01060-205ENST00000512839 716 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 TBCA-203ENST00000517679 545 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 LINC01900-202ENST00000584898 603 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AC139769.3-201ENST00000618383 175 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 LINC00901-201ENST00000487512 1452 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AL583835.1-201ENST00000399570 407 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AL513174.1-201ENST00000423182 629 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AL354977.2-201ENST00000430387 728 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AC073284.1-201ENST00000448086 404 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AC093903.1-201ENST00000507220 405 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 KPNA2P3-201ENST00000584190 848 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AC103810.2-203ENST00000584959 631 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AC091132.5-204ENST00000586348 630 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 DTNA-232ENST00000599844 853 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AL353726.1-201ENST00000614041 1000 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 RNU1-87P-201ENST00000363727 170 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 CLEC7A-206ENST00000396484 1000 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 MFAP5-202ENST00000396549 1195 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.2 ms