Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
USF2Q15853 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
USF2Q15853 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
USF2Q15853 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
USF2Q15853 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
USF2Q15853 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
USF2Q15853 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
USF2Q15853 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
USF2Q15853 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
USF2Q15853 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
USF2Q15853 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
USF2Q15853 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC3.01□□□□□ -1.93
USF2Q15853 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
USF2Q15853 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
USF2Q15853 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC3□□□□□ -1.93
USF2Q15853 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
USF2Q15853 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
USF2Q15853 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
USF2Q15853 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC3□□□□□ -1.93
USF2Q15853 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC3□□□□□ -1.93
USF2Q15853 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC3□□□□□ -1.93
USF2Q15853 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
USF2Q15853 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC3□□□□□ -1.93
USF2Q15853 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC3□□□□□ -1.93
USF2Q15853 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
USF2Q15853 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
USF2Q15853 OR5AW1P-201ENST00000426334 1006 ntBASIC3□□□□□ -1.93
USF2Q15853 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC3□□□□□ -1.93
USF2Q15853 AL360089.1-201ENST00000442260 436 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
USF2Q15853 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
USF2Q15853 ANKRD30BP3-201ENST00000444850 1070 ntBASIC3□□□□□ -1.93
USF2Q15853 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC3□□□□□ -1.93
USF2Q15853 BIRC6-AS1-201ENST00000455572 697 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
USF2Q15853 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
USF2Q15853 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC3□□□□□ -1.93
USF2Q15853 SSR3-208ENST00000496050 579 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
USF2Q15853 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC3□□□□□ -1.93
USF2Q15853 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
USF2Q15853 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC3□□□□□ -1.93
USF2Q15853 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
USF2Q15853 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC3□□□□□ -1.93
USF2Q15853 OR4A12P-201ENST00000530847 918 ntBASIC3□□□□□ -1.93
USF2Q15853 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
USF2Q15853 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC3□□□□□ -1.93
USF2Q15853 AC051619.4-201ENST00000560034 292 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
USF2Q15853 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC3□□□□□ -1.93
USF2Q15853 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
USF2Q15853 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC3□□□□□ -1.93
USF2Q15853 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC3□□□□□ -1.93
USF2Q15853 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC3□□□□□ -1.93
USF2Q15853 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
USF2Q15853 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
USF2Q15853 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
USF2Q15853 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
USF2Q15853 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
USF2Q15853 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC3□□□□□ -1.93
USF2Q15853 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
USF2Q15853 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
USF2Q15853 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
USF2Q15853 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
USF2Q15853 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
USF2Q15853 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
USF2Q15853 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
USF2Q15853 FABP12P1-201ENST00000401911 322 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
USF2Q15853 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
USF2Q15853 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
USF2Q15853 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
USF2Q15853 AL122010.1-201ENST00000429293 720 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
USF2Q15853 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
USF2Q15853 AC003092.1-202ENST00000438538 743 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
USF2Q15853 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
USF2Q15853 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
USF2Q15853 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
USF2Q15853 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
USF2Q15853 LINC02479-201ENST00000508942 630 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
USF2Q15853 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
USF2Q15853 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
USF2Q15853 TMPRSS11BNL-205ENST00000514295 1262 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
USF2Q15853 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
USF2Q15853 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
USF2Q15853 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
USF2Q15853 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
USF2Q15853 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
USF2Q15853 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
USF2Q15853 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
USF2Q15853 AC022929.1-201ENST00000560675 823 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
USF2Q15853 AC100872.1-201ENST00000577765 501 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
USF2Q15853 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
USF2Q15853 AL513477.2-201ENST00000607858 568 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
USF2Q15853 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
USF2Q15853 AC073530.2-201ENST00000623987 261 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
USF2Q15853 AC090506.2-201ENST00000624521 419 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
USF2Q15853 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
USF2Q15853 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
USF2Q15853 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
USF2Q15853 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
USF2Q15853 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
USF2Q15853 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
USF2Q15853 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
USF2Q15853 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
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