Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 IPO5-222ENST00000490680 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PCDH10Q9P2E7 DLG2-203ENST00000376104 5139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PCDH10Q9P2E7 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PCDH10Q9P2E7 CA10-204ENST00000570565 2276 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PCDH10Q9P2E7 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PCDH10Q9P2E7 FASTKD1-204ENST00000453153 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PCDH10Q9P2E7 NBPF12-203ENST00000611443 5594 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PCDH10Q9P2E7 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PCDH10Q9P2E7 CLCN3-209ENST00000513761 6692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PCDH10Q9P2E7 MYLK4-201ENST00000274643 5806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PCDH10Q9P2E7 GJA1-201ENST00000282561 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PCDH10Q9P2E7 CCNB3-204ENST00000376042 4693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PCDH10Q9P2E7 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PCDH10Q9P2E7 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PCDH10Q9P2E7 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PCDH10Q9P2E7 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PCDH10Q9P2E7 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PCDH10Q9P2E7 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PCDH10Q9P2E7 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PCDH10Q9P2E7 CBX1P4-201ENST00000439415 457 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PCDH10Q9P2E7 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PCDH10Q9P2E7 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PCDH10Q9P2E7 ARPP21-231ENST00000474696 572 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PCDH10Q9P2E7 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PCDH10Q9P2E7 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PCDH10Q9P2E7 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PCDH10Q9P2E7 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PCDH10Q9P2E7 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PCDH10Q9P2E7 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PCDH10Q9P2E7 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PCDH10Q9P2E7 AL590032.1-201ENST00000604920 252 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PCDH10Q9P2E7 SPATA31A7-206ENST00000619167 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PCDH10Q9P2E7 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PCDH10Q9P2E7 GABRQ-201ENST00000598523 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PCDH10Q9P2E7 VNN3-202ENST00000367927 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PCDH10Q9P2E7 MRPS27-202ENST00000457646 2628 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PCDH10Q9P2E7 KIDINS220-206ENST00000473731 7248 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PCDH10Q9P2E7 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PCDH10Q9P2E7 DLG2-209ENST00000418306 3027 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PCDH10Q9P2E7 ACPP-202ENST00000351273 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PCDH10Q9P2E7 ERC1-204ENST00000397203 9118 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PCDH10Q9P2E7 NUP214-202ENST00000411637 7538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PCDH10Q9P2E7 CD46-201ENST00000322875 3278 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PCDH10Q9P2E7 CD46-207ENST00000367041 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PCDH10Q9P2E7 ZNF235-201ENST00000291182 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PCDH10Q9P2E7 MAML2-202ENST00000618849 3154 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PCDH10Q9P2E7 FAM217B-202ENST00000360816 5036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PCDH10Q9P2E7 MAP2-203ENST00000361559 2038 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PCDH10Q9P2E7 ANK2-212ENST00000506722 8051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PCDH10Q9P2E7 GOLGB1-209ENST00000614479 11115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PCDH10Q9P2E7 FGD4-202ENST00000427716 8242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PCDH10Q9P2E7 CD163-209ENST00000541972 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PCDH10Q9P2E7 E2F8-201ENST00000250024 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PCDH10Q9P2E7 SPARCL1-205ENST00000503414 2520 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PCDH10Q9P2E7 LINC02197-201ENST00000502659 2767 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PCDH10Q9P2E7 MAPK10-377ENST00000642006 2752 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PCDH10Q9P2E7 PRDM2-201ENST00000235372 7957 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PCDH10Q9P2E7 DNAH17-202ENST00000585328 13708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PCDH10Q9P2E7 LINC02209-201ENST00000521245 2651 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PCDH10Q9P2E7 RASGRP3-202ENST00000403687 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PCDH10Q9P2E7 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PCDH10Q9P2E7 TDRD3-209ENST00000621840 2497 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PCDH10Q9P2E7 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PCDH10Q9P2E7 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PCDH10Q9P2E7 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PCDH10Q9P2E7 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PCDH10Q9P2E7 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PCDH10Q9P2E7 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PCDH10Q9P2E7 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PCDH10Q9P2E7 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PCDH10Q9P2E7 FGF13-AS1-201ENST00000438238 849 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PCDH10Q9P2E7 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PCDH10Q9P2E7 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PCDH10Q9P2E7 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
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PCDH10Q9P2E7 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PCDH10Q9P2E7 PSMA6-214ENST00000556506 763 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PCDH10Q9P2E7 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PCDH10Q9P2E7 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PCDH10Q9P2E7 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PCDH10Q9P2E7 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PCDH10Q9P2E7 AC091768.1-201ENST00000609258 930 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PCDH10Q9P2E7 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PCDH10Q9P2E7 AC073488.9-201ENST00000631601 754 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PCDH10Q9P2E7 ZMYND8-216ENST00000471951 4053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PCDH10Q9P2E7 HDAC9-214ENST00000441542 3210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PCDH10Q9P2E7 FBXW10-202ENST00000308799 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PCDH10Q9P2E7 AC006058.1-201ENST00000568686 5067 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PCDH10Q9P2E7 BRINP3-201ENST00000367462 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PCDH10Q9P2E7 PEX13-201ENST00000295030 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PCDH10Q9P2E7 ENSA-204ENST00000356527 2546 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PCDH10Q9P2E7 PRLR-219ENST00000619676 1402 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PCDH10Q9P2E7 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PCDH10Q9P2E7 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PCDH10Q9P2E7 EFCAB6-203ENST00000396231 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PCDH10Q9P2E7 MDM4-207ENST00000454264 9926 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PCDH10Q9P2E7 NBPF3-202ENST00000318249 3591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PCDH10Q9P2E7 TMPRSS11F-201ENST00000356291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PCDH10Q9P2E7 NEDD9-208ENST00000504387 3211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PCDH10Q9P2E7 XPO1-202ENST00000404992 4105 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
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