Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 OR7E13P-201ENST00000526052 910 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCAQ16586 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCAQ16586 AC007688.2-201ENST00000545158 369 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCAQ16586 AC013437.1-201ENST00000549878 414 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCAQ16586 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCAQ16586 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCAQ16586 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCAQ16586 LINC01255-206ENST00000591431 441 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCAQ16586 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCAQ16586 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCAQ16586 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCAQ16586 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCAQ16586 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCAQ16586 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCAQ16586 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCAQ16586 POU1F1-202ENST00000350375 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCAQ16586 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCAQ16586 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCAQ16586 AC020637.1-201ENST00000546977 1447 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCAQ16586 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCAQ16586 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCAQ16586 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCAQ16586 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SGCAQ16586 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SGCAQ16586 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SGCAQ16586 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SGCAQ16586 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SGCAQ16586 CSN1S1-201ENST00000246891 985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SGCAQ16586 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SGCAQ16586 RPL9-201ENST00000295955 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SGCAQ16586 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
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SGCAQ16586 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SGCAQ16586 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
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SGCAQ16586 GCG-202ENST00000418842 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
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SGCAQ16586 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
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SGCAQ16586 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
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SGCAQ16586 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCAQ16586 RPL6P5-201ENST00000445678 828 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCAQ16586 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCAQ16586 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCAQ16586 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SGCAQ16586 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
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