Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC1.77□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AC098824.1-201ENST00000453565 980 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 USP9YP2-201ENST00000504503 1000 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 USP9YP1-201ENST00000513521 1002 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AC106730.3-201ENST00000624568 641 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 RNU6-618P-201ENST00000363518 112 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 FAM26F-203ENST00000368606 546 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AL353608.2-201ENST00000425587 340 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC1.77□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AC022826.2-201ENST00000358757 776 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC1.76□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AL139240.1-201ENST00000422963 505 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AC099677.4-201ENST00000446786 380 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 LINC01034-201ENST00000448806 277 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 NPM1P29-201ENST00000483112 803 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AC068020.1-201ENST00000594215 661 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 TMED3-202ENST00000424155 16555 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AC112492.1-201ENST00000449607 712 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 SKP1-210ENST00000522855 802 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 FAM49B-230ENST00000639004 837 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AC011287.1-204ENST00000640300 1213 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 OR2M3-202ENST00000641626 9913 ntAPPRIS P1 BASIC1.76□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 IFNNP1-201ENST00000429219 553 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC1.76□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 MOB1AP1-201ENST00000430903 535 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC1.76□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 ARL4AP3-201ENST00000441452 574 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
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