Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 LINC01967-201ENST00000356047 755 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 AL034376.1-201ENST00000380106 484 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 ATXN10-203ENST00000402380 564 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 AC062031.1-201ENST00000414967 747 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 MTCO1P57-201ENST00000432182 261 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 Z74696.2-201ENST00000436514 498 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 AC074327.1-201ENST00000448017 540 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 SNAP25-AS1-204ENST00000451151 867 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 PWRN3-201ENST00000566797 849 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 AGGF1P6-201ENST00000569213 976 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 AC021517.1-203ENST00000590257 421 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 NTAN1P1-201ENST00000603150 646 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 OR8F1P-201ENST00000425243 930 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 AC018731.1-201ENST00000447078 576 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 AL157400.3-201ENST00000449882 1298 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 HMGB1P5-202ENST00000451497 985 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 OR9M1P-201ENST00000459641 921 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 AC126121.1-201ENST00000482313 553 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 AC018816.1-205ENST00000489771 509 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 AC093770.1-201ENST00000511559 571 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
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IFT88Q13099 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
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IFT88Q13099 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 AP000462.1-201ENST00000535704 818 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 AC009803.3-201ENST00000548457 540 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 AC006960.3-201ENST00000561845 705 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 AC023490.1-202ENST00000620909 820 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 ZNF92P1Y-201ENST00000415010 1191 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
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