Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 HSPA8P19-201ENST00000505359 1517 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 LIX1L-AS1-201ENST00000366105 377 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 RSL24D1P1-201ENST00000404972 493 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 MTCYBP29-201ENST00000436327 1006 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 XKRYP6-201ENST00000440468 1116 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 XKRYP3-201ENST00000442113 1116 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 MTND2P8-201ENST00000450555 1025 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 SNAP25-AS1-204ENST00000451151 867 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AL513343.1-201ENST00000451818 792 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 LINC02027-201ENST00000482617 596 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AC079089.1-202ENST00000528800 1256 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 NR1H4-204ENST00000546380 565 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AL445423.1-201ENST00000609941 536 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 ATP6V1G3-201ENST00000281087 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 ATP6V1G3-202ENST00000309309 678 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 UQCR10-201ENST00000330029 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 LINC01614-201ENST00000415479 648 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 YY1P1-201ENST00000427625 668 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 CEACAMP9-201ENST00000442990 513 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 RN7SKP141-201ENST00000516167 338 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 C1GALT1P3-201ENST00000522049 819 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 RGS5-218ENST00000526176 574 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 CR383656.6-201ENST00000550518 394 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 AC099518.4-204ENST00000567047 380 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 AGGF1P6-201ENST00000569213 976 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 AL391497.1-201ENST00000608671 547 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 AC015726.3-201ENST00000624501 418 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 TATDN1-221ENST00000630259 915 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 BRWD1P3-201ENST00000428816 390 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 RRM2P4-201ENST00000441721 562 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
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