Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 TUBD1-204ENST00000376094 1154 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AC092647.1-201ENST00000420654 287 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 LINC01468-201ENST00000422763 570 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 KCTD9P3-201ENST00000434597 1169 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 ELOCP8-201ENST00000439309 332 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 ELOCP15-201ENST00000442090 332 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 SETD6P1-201ENST00000444575 317 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 RPL7P24-201ENST00000493052 752 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AC005351.1-201ENST00000511152 786 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AC027701.1-202ENST00000520988 459 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AL356121.2-201ENST00000624715 780 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 SLC38A11-204ENST00000409662 1542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 GLIPR1L1-201ENST00000312442 1132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 POLR1D-202ENST00000399696 668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AC073071.1-201ENST00000412410 388 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 LINC01362-201ENST00000419658 338 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 NPM1P34-201ENST00000428821 893 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AP000855.1-201ENST00000433210 636 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 TMEM68-206ENST00000519784 1009 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AP003472.1-201ENST00000519844 644 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 LINC02131-201ENST00000563289 419 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 MMP2-AS1-202ENST00000569037 553 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 LINC01930-201ENST00000602672 870 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AC125613.1-204ENST00000636224 1248 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AC138393.1-206ENST00000540997 1886 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 CYP3A7-CYP3A51P-201ENST00000611620 1608 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 EMCN-209ENST00000511970 1377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms