Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 IGHVIII-67-4-201ENST00000524281 296 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AC079075.1-201ENST00000559543 878 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
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FOXE3Q13461 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AC010998.2-201ENST00000605549 625 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 BX323046.1-201ENST00000610145 535 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
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FOXE3Q13461 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
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FOXE3Q13461 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
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FOXE3Q13461 AL355480.1-201ENST00000629041 99 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 UOX-205ENST00000640983 544 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
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FOXE3Q13461 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AC119744.1-201ENST00000454746 1715 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
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FOXE3Q13461 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
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FOXE3Q13461 AL450996.1-201ENST00000445574 1202 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
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FOXE3Q13461 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
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FOXE3Q13461 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AP001970.1-201ENST00000531681 701 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 DERA-209ENST00000532964 854 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
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