Protein–RNA interactions for Protein: S4R3C0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S4R3C0 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
S4R3C0 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
S4R3C0 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
S4R3C0 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
S4R3C0 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
S4R3C0 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
S4R3C0 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
S4R3C0 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
S4R3C0 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
S4R3C0 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
S4R3C0 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
S4R3C0 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
S4R3C0 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
S4R3C0 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
S4R3C0 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
S4R3C0 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
S4R3C0 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
S4R3C0 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
S4R3C0 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
S4R3C0 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
S4R3C0 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
S4R3C0 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
S4R3C0 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
S4R3C0 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
S4R3C0 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
S4R3C0 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
S4R3C0 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
S4R3C0 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
S4R3C0 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
S4R3C0 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
S4R3C0 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
S4R3C0 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
S4R3C0 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
S4R3C0 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
S4R3C0 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
S4R3C0 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
S4R3C0 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
S4R3C0 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
S4R3C0 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
S4R3C0 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
S4R3C0 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
S4R3C0 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
S4R3C0 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
S4R3C0 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
S4R3C0 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
S4R3C0 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
S4R3C0 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
S4R3C0 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
S4R3C0 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
S4R3C0 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
S4R3C0 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
S4R3C0 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
S4R3C0 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
S4R3C0 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
S4R3C0 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
S4R3C0 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
S4R3C0 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
S4R3C0 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
S4R3C0 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
S4R3C0 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
S4R3C0 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
S4R3C0 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
S4R3C0 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
S4R3C0 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
S4R3C0 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
S4R3C0 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
S4R3C0 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
S4R3C0 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
S4R3C0 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
S4R3C0 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
S4R3C0 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
S4R3C0 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
S4R3C0 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
S4R3C0 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
S4R3C0 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
S4R3C0 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
S4R3C0 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
S4R3C0 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
S4R3C0 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
S4R3C0 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
S4R3C0 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
S4R3C0 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
S4R3C0 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
S4R3C0 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
S4R3C0 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
S4R3C0 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
S4R3C0 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
S4R3C0 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
S4R3C0 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
S4R3C0 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
S4R3C0 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
S4R3C0 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
S4R3C0 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
S4R3C0 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
S4R3C0 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
S4R3C0 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
S4R3C0 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
S4R3C0 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
S4R3C0 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
S4R3C0 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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