Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Z2

LINC01558, Uncharacterized protein encoded by LINC01558, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01558Q9Y6Z2 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms