Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SLC4A4Q9Y6R1 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms