Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D6

ARFGEF1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF1Q9Y6D6 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARFGEF1Q9Y6D6 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARFGEF1Q9Y6D6 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARFGEF1Q9Y6D6 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARFGEF1Q9Y6D6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARFGEF1Q9Y6D6 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARFGEF1Q9Y6D6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARFGEF1Q9Y6D6 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARFGEF1Q9Y6D6 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARFGEF1Q9Y6D6 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARFGEF1Q9Y6D6 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARFGEF1Q9Y6D6 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARFGEF1Q9Y6D6 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARFGEF1Q9Y6D6 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARFGEF1Q9Y6D6 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ARFGEF1Q9Y6D6 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARFGEF1Q9Y6D6 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARFGEF1Q9Y6D6 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARFGEF1Q9Y6D6 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARFGEF1Q9Y6D6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARFGEF1Q9Y6D6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARFGEF1Q9Y6D6 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARFGEF1Q9Y6D6 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARFGEF1Q9Y6D6 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARFGEF1Q9Y6D6 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARFGEF1Q9Y6D6 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARFGEF1Q9Y6D6 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ARFGEF1Q9Y6D6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARFGEF1Q9Y6D6 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARFGEF1Q9Y6D6 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARFGEF1Q9Y6D6 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARFGEF1Q9Y6D6 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARFGEF1Q9Y6D6 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ARFGEF1Q9Y6D6 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARFGEF1Q9Y6D6 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARFGEF1Q9Y6D6 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ARFGEF1Q9Y6D6 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ARFGEF1Q9Y6D6 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ARFGEF1Q9Y6D6 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ARFGEF1Q9Y6D6 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ARFGEF1Q9Y6D6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARFGEF1Q9Y6D6 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARFGEF1Q9Y6D6 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARFGEF1Q9Y6D6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARFGEF1Q9Y6D6 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARFGEF1Q9Y6D6 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARFGEF1Q9Y6D6 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARFGEF1Q9Y6D6 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARFGEF1Q9Y6D6 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARFGEF1Q9Y6D6 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARFGEF1Q9Y6D6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARFGEF1Q9Y6D6 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARFGEF1Q9Y6D6 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARFGEF1Q9Y6D6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARFGEF1Q9Y6D6 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARFGEF1Q9Y6D6 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ARFGEF1Q9Y6D6 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARFGEF1Q9Y6D6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARFGEF1Q9Y6D6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARFGEF1Q9Y6D6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARFGEF1Q9Y6D6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARFGEF1Q9Y6D6 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARFGEF1Q9Y6D6 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ARFGEF1Q9Y6D6 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARFGEF1Q9Y6D6 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ARFGEF1Q9Y6D6 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARFGEF1Q9Y6D6 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARFGEF1Q9Y6D6 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARFGEF1Q9Y6D6 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARFGEF1Q9Y6D6 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARFGEF1Q9Y6D6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARFGEF1Q9Y6D6 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARFGEF1Q9Y6D6 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARFGEF1Q9Y6D6 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARFGEF1Q9Y6D6 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ARFGEF1Q9Y6D6 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARFGEF1Q9Y6D6 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARFGEF1Q9Y6D6 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARFGEF1Q9Y6D6 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARFGEF1Q9Y6D6 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARFGEF1Q9Y6D6 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ARFGEF1Q9Y6D6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARFGEF1Q9Y6D6 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARFGEF1Q9Y6D6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARFGEF1Q9Y6D6 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARFGEF1Q9Y6D6 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARFGEF1Q9Y6D6 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARFGEF1Q9Y6D6 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARFGEF1Q9Y6D6 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARFGEF1Q9Y6D6 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARFGEF1Q9Y6D6 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARFGEF1Q9Y6D6 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARFGEF1Q9Y6D6 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARFGEF1Q9Y6D6 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARFGEF1Q9Y6D6 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARFGEF1Q9Y6D6 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARFGEF1Q9Y6D6 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARFGEF1Q9Y6D6 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms