Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP16Q9Y5T5 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms