Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

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Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HCN4Q9Y3Q4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HCN4Q9Y3Q4 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HCN4Q9Y3Q4 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HCN4Q9Y3Q4 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HCN4Q9Y3Q4 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HCN4Q9Y3Q4 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HCN4Q9Y3Q4 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HCN4Q9Y3Q4 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HCN4Q9Y3Q4 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HCN4Q9Y3Q4 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HCN4Q9Y3Q4 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HCN4Q9Y3Q4 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HCN4Q9Y3Q4 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HCN4Q9Y3Q4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HCN4Q9Y3Q4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HCN4Q9Y3Q4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HCN4Q9Y3Q4 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HCN4Q9Y3Q4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HCN4Q9Y3Q4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HCN4Q9Y3Q4 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HCN4Q9Y3Q4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
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HCN4Q9Y3Q4 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
HCN4Q9Y3Q4 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HCN4Q9Y3Q4 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HCN4Q9Y3Q4 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HCN4Q9Y3Q4 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
HCN4Q9Y3Q4 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HCN4Q9Y3Q4 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
HCN4Q9Y3Q4 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HCN4Q9Y3Q4 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
HCN4Q9Y3Q4 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
HCN4Q9Y3Q4 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HCN4Q9Y3Q4 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HCN4Q9Y3Q4 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HCN4Q9Y3Q4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HCN4Q9Y3Q4 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
HCN4Q9Y3Q4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
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HCN4Q9Y3Q4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HCN4Q9Y3Q4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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HCN4Q9Y3Q4 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HCN4Q9Y3Q4 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
HCN4Q9Y3Q4 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HCN4Q9Y3Q4 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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HCN4Q9Y3Q4 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HCN4Q9Y3Q4 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HCN4Q9Y3Q4 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HCN4Q9Y3Q4 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HCN4Q9Y3Q4 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HCN4Q9Y3Q4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HCN4Q9Y3Q4 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HCN4Q9Y3Q4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HCN4Q9Y3Q4 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HCN4Q9Y3Q4 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HCN4Q9Y3Q4 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HCN4Q9Y3Q4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HCN4Q9Y3Q4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HCN4Q9Y3Q4 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
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HCN4Q9Y3Q4 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HCN4Q9Y3Q4 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
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HCN4Q9Y3Q4 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
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HCN4Q9Y3Q4 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HCN4Q9Y3Q4 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HCN4Q9Y3Q4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HCN4Q9Y3Q4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HCN4Q9Y3Q4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HCN4Q9Y3Q4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HCN4Q9Y3Q4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HCN4Q9Y3Q4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HCN4Q9Y3Q4 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HCN4Q9Y3Q4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HCN4Q9Y3Q4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HCN4Q9Y3Q4 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HCN4Q9Y3Q4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HCN4Q9Y3Q4 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HCN4Q9Y3Q4 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
HCN4Q9Y3Q4 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
HCN4Q9Y3Q4 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HCN4Q9Y3Q4 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HCN4Q9Y3Q4 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HCN4Q9Y3Q4 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
HCN4Q9Y3Q4 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HCN4Q9Y3Q4 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HCN4Q9Y3Q4 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
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