Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A6

TMED5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED5Q9Y3A6 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMED5Q9Y3A6 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMED5Q9Y3A6 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMED5Q9Y3A6 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMED5Q9Y3A6 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMED5Q9Y3A6 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMED5Q9Y3A6 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMED5Q9Y3A6 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMED5Q9Y3A6 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMED5Q9Y3A6 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMED5Q9Y3A6 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMED5Q9Y3A6 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMED5Q9Y3A6 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMED5Q9Y3A6 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMED5Q9Y3A6 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMED5Q9Y3A6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMED5Q9Y3A6 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMED5Q9Y3A6 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMED5Q9Y3A6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMED5Q9Y3A6 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMED5Q9Y3A6 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMED5Q9Y3A6 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMED5Q9Y3A6 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMED5Q9Y3A6 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMED5Q9Y3A6 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMED5Q9Y3A6 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMED5Q9Y3A6 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMED5Q9Y3A6 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMED5Q9Y3A6 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMED5Q9Y3A6 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMED5Q9Y3A6 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMED5Q9Y3A6 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMED5Q9Y3A6 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMED5Q9Y3A6 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMED5Q9Y3A6 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMED5Q9Y3A6 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMED5Q9Y3A6 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMED5Q9Y3A6 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMED5Q9Y3A6 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMED5Q9Y3A6 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMED5Q9Y3A6 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMED5Q9Y3A6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMED5Q9Y3A6 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMED5Q9Y3A6 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMED5Q9Y3A6 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TMED5Q9Y3A6 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TMED5Q9Y3A6 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMED5Q9Y3A6 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMED5Q9Y3A6 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMED5Q9Y3A6 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMED5Q9Y3A6 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMED5Q9Y3A6 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMED5Q9Y3A6 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMED5Q9Y3A6 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMED5Q9Y3A6 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMED5Q9Y3A6 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMED5Q9Y3A6 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMED5Q9Y3A6 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMED5Q9Y3A6 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMED5Q9Y3A6 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TMED5Q9Y3A6 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMED5Q9Y3A6 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMED5Q9Y3A6 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMED5Q9Y3A6 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMED5Q9Y3A6 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMED5Q9Y3A6 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMED5Q9Y3A6 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMED5Q9Y3A6 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMED5Q9Y3A6 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMED5Q9Y3A6 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMED5Q9Y3A6 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMED5Q9Y3A6 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMED5Q9Y3A6 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMED5Q9Y3A6 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMED5Q9Y3A6 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMED5Q9Y3A6 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMED5Q9Y3A6 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMED5Q9Y3A6 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMED5Q9Y3A6 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMED5Q9Y3A6 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMED5Q9Y3A6 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMED5Q9Y3A6 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMED5Q9Y3A6 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMED5Q9Y3A6 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMED5Q9Y3A6 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TMED5Q9Y3A6 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TMED5Q9Y3A6 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMED5Q9Y3A6 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMED5Q9Y3A6 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMED5Q9Y3A6 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMED5Q9Y3A6 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMED5Q9Y3A6 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMED5Q9Y3A6 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMED5Q9Y3A6 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMED5Q9Y3A6 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMED5Q9Y3A6 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TMED5Q9Y3A6 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMED5Q9Y3A6 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMED5Q9Y3A6 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMED5Q9Y3A6 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms