Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
THRAP3Q9Y2W1 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
THRAP3Q9Y2W1 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
THRAP3Q9Y2W1 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
THRAP3Q9Y2W1 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
THRAP3Q9Y2W1 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
THRAP3Q9Y2W1 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
THRAP3Q9Y2W1 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
THRAP3Q9Y2W1 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
THRAP3Q9Y2W1 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
THRAP3Q9Y2W1 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
THRAP3Q9Y2W1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
THRAP3Q9Y2W1 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
THRAP3Q9Y2W1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms