Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U9

KLHDC2, Kelch domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC2Q9Y2U9 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHDC2Q9Y2U9 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms