Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRAPPC8Q9Y2L5 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
TRAPPC8Q9Y2L5 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
TRAPPC8Q9Y2L5 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
TRAPPC8Q9Y2L5 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRAPPC8Q9Y2L5 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRAPPC8Q9Y2L5 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRAPPC8Q9Y2L5 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
TRAPPC8Q9Y2L5 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRAPPC8Q9Y2L5 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRAPPC8Q9Y2L5 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
TRAPPC8Q9Y2L5 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRAPPC8Q9Y2L5 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRAPPC8Q9Y2L5 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRAPPC8Q9Y2L5 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRAPPC8Q9Y2L5 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
TRAPPC8Q9Y2L5 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRAPPC8Q9Y2L5 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRAPPC8Q9Y2L5 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRAPPC8Q9Y2L5 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRAPPC8Q9Y2L5 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRAPPC8Q9Y2L5 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
TRAPPC8Q9Y2L5 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRAPPC8Q9Y2L5 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
TRAPPC8Q9Y2L5 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
TRAPPC8Q9Y2L5 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
TRAPPC8Q9Y2L5 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRAPPC8Q9Y2L5 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRAPPC8Q9Y2L5 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRAPPC8Q9Y2L5 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRAPPC8Q9Y2L5 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRAPPC8Q9Y2L5 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
TRAPPC8Q9Y2L5 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRAPPC8Q9Y2L5 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRAPPC8Q9Y2L5 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRAPPC8Q9Y2L5 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRAPPC8Q9Y2L5 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRAPPC8Q9Y2L5 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRAPPC8Q9Y2L5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRAPPC8Q9Y2L5 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
TRAPPC8Q9Y2L5 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
TRAPPC8Q9Y2L5 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRAPPC8Q9Y2L5 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRAPPC8Q9Y2L5 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRAPPC8Q9Y2L5 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRAPPC8Q9Y2L5 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRAPPC8Q9Y2L5 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRAPPC8Q9Y2L5 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRAPPC8Q9Y2L5 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRAPPC8Q9Y2L5 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRAPPC8Q9Y2L5 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRAPPC8Q9Y2L5 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRAPPC8Q9Y2L5 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRAPPC8Q9Y2L5 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRAPPC8Q9Y2L5 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
TRAPPC8Q9Y2L5 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRAPPC8Q9Y2L5 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRAPPC8Q9Y2L5 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRAPPC8Q9Y2L5 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms