Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms