Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
HPS5Q9UPZ3 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms