Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SETD1BQ9UPS6 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SETD1BQ9UPS6 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms