Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86 ms