Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2IRD1Q9UHL9 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2IRD1Q9UHL9 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2IRD1Q9UHL9 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2IRD1Q9UHL9 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2IRD1Q9UHL9 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2IRD1Q9UHL9 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2IRD1Q9UHL9 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2IRD1Q9UHL9 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2IRD1Q9UHL9 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2IRD1Q9UHL9 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2IRD1Q9UHL9 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2IRD1Q9UHL9 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2IRD1Q9UHL9 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2IRD1Q9UHL9 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2IRD1Q9UHL9 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2IRD1Q9UHL9 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2IRD1Q9UHL9 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2IRD1Q9UHL9 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2IRD1Q9UHL9 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2IRD1Q9UHL9 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2IRD1Q9UHL9 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2IRD1Q9UHL9 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2IRD1Q9UHL9 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2IRD1Q9UHL9 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2IRD1Q9UHL9 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2IRD1Q9UHL9 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2IRD1Q9UHL9 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2IRD1Q9UHL9 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2IRD1Q9UHL9 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2IRD1Q9UHL9 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2IRD1Q9UHL9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2IRD1Q9UHL9 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2IRD1Q9UHL9 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2IRD1Q9UHL9 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2IRD1Q9UHL9 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2IRD1Q9UHL9 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2IRD1Q9UHL9 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2IRD1Q9UHL9 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2IRD1Q9UHL9 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2IRD1Q9UHL9 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2IRD1Q9UHL9 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2IRD1Q9UHL9 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2IRD1Q9UHL9 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2IRD1Q9UHL9 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2IRD1Q9UHL9 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2IRD1Q9UHL9 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2IRD1Q9UHL9 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2IRD1Q9UHL9 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2IRD1Q9UHL9 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2IRD1Q9UHL9 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2IRD1Q9UHL9 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2IRD1Q9UHL9 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2IRD1Q9UHL9 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2IRD1Q9UHL9 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2IRD1Q9UHL9 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2IRD1Q9UHL9 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2IRD1Q9UHL9 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2IRD1Q9UHL9 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2IRD1Q9UHL9 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms