Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC6Q9UBN7 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms