Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms