Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms