Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
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