Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HMG20BQ9P0W2 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMG20BQ9P0W2 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms