Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W0

IFNK, Interferon kappa, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNKQ9P0W0 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFNKQ9P0W0 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IFNKQ9P0W0 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFNKQ9P0W0 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IFNKQ9P0W0 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IFNKQ9P0W0 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFNKQ9P0W0 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFNKQ9P0W0 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFNKQ9P0W0 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFNKQ9P0W0 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFNKQ9P0W0 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
IFNKQ9P0W0 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFNKQ9P0W0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.28■■□□□ 1
IFNKQ9P0W0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IFNKQ9P0W0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.28■■□□□ 1
IFNKQ9P0W0 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFNKQ9P0W0 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IFNKQ9P0W0 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFNKQ9P0W0 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFNKQ9P0W0 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IFNKQ9P0W0 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFNKQ9P0W0 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFNKQ9P0W0 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IFNKQ9P0W0 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IFNKQ9P0W0 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFNKQ9P0W0 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IFNKQ9P0W0 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
IFNKQ9P0W0 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IFNKQ9P0W0 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IFNKQ9P0W0 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IFNKQ9P0W0 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IFNKQ9P0W0 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IFNKQ9P0W0 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.27■■□□□ 1
IFNKQ9P0W0 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IFNKQ9P0W0 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IFNKQ9P0W0 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
IFNKQ9P0W0 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.27■■□□□ 1
IFNKQ9P0W0 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IFNKQ9P0W0 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
IFNKQ9P0W0 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
IFNKQ9P0W0 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IFNKQ9P0W0 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
IFNKQ9P0W0 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IFNKQ9P0W0 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
IFNKQ9P0W0 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
IFNKQ9P0W0 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFNKQ9P0W0 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFNKQ9P0W0 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFNKQ9P0W0 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFNKQ9P0W0 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFNKQ9P0W0 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFNKQ9P0W0 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFNKQ9P0W0 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFNKQ9P0W0 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFNKQ9P0W0 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFNKQ9P0W0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFNKQ9P0W0 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
IFNKQ9P0W0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFNKQ9P0W0 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFNKQ9P0W0 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFNKQ9P0W0 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFNKQ9P0W0 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFNKQ9P0W0 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFNKQ9P0W0 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFNKQ9P0W0 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFNKQ9P0W0 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFNKQ9P0W0 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFNKQ9P0W0 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFNKQ9P0W0 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFNKQ9P0W0 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFNKQ9P0W0 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFNKQ9P0W0 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFNKQ9P0W0 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFNKQ9P0W0 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFNKQ9P0W0 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFNKQ9P0W0 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFNKQ9P0W0 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFNKQ9P0W0 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFNKQ9P0W0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFNKQ9P0W0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
IFNKQ9P0W0 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFNKQ9P0W0 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFNKQ9P0W0 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
IFNKQ9P0W0 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFNKQ9P0W0 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFNKQ9P0W0 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFNKQ9P0W0 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFNKQ9P0W0 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFNKQ9P0W0 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFNKQ9P0W0 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFNKQ9P0W0 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFNKQ9P0W0 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFNKQ9P0W0 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFNKQ9P0W0 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFNKQ9P0W0 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFNKQ9P0W0 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFNKQ9P0W0 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFNKQ9P0W0 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFNKQ9P0W0 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFNKQ9P0W0 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms