Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J1

PDP1, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1Q9P0J1 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDP1Q9P0J1 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDP1Q9P0J1 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDP1Q9P0J1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDP1Q9P0J1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDP1Q9P0J1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDP1Q9P0J1 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDP1Q9P0J1 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDP1Q9P0J1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDP1Q9P0J1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PDP1Q9P0J1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDP1Q9P0J1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDP1Q9P0J1 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDP1Q9P0J1 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDP1Q9P0J1 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDP1Q9P0J1 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDP1Q9P0J1 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDP1Q9P0J1 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDP1Q9P0J1 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDP1Q9P0J1 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PDP1Q9P0J1 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDP1Q9P0J1 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDP1Q9P0J1 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDP1Q9P0J1 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDP1Q9P0J1 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDP1Q9P0J1 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDP1Q9P0J1 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDP1Q9P0J1 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDP1Q9P0J1 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDP1Q9P0J1 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDP1Q9P0J1 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDP1Q9P0J1 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDP1Q9P0J1 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDP1Q9P0J1 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms