Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MIS18AQ9NYP9 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MIS18AQ9NYP9 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MIS18AQ9NYP9 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MIS18AQ9NYP9 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MIS18AQ9NYP9 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MIS18AQ9NYP9 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MIS18AQ9NYP9 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MIS18AQ9NYP9 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MIS18AQ9NYP9 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MIS18AQ9NYP9 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MIS18AQ9NYP9 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MIS18AQ9NYP9 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MIS18AQ9NYP9 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MIS18AQ9NYP9 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MIS18AQ9NYP9 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MIS18AQ9NYP9 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MIS18AQ9NYP9 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MIS18AQ9NYP9 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MIS18AQ9NYP9 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MIS18AQ9NYP9 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MIS18AQ9NYP9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MIS18AQ9NYP9 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MIS18AQ9NYP9 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MIS18AQ9NYP9 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
MIS18AQ9NYP9 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MIS18AQ9NYP9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MIS18AQ9NYP9 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MIS18AQ9NYP9 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MIS18AQ9NYP9 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MIS18AQ9NYP9 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MIS18AQ9NYP9 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MIS18AQ9NYP9 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MIS18AQ9NYP9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MIS18AQ9NYP9 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MIS18AQ9NYP9 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MIS18AQ9NYP9 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MIS18AQ9NYP9 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
MIS18AQ9NYP9 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MIS18AQ9NYP9 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
MIS18AQ9NYP9 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MIS18AQ9NYP9 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
MIS18AQ9NYP9 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MIS18AQ9NYP9 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MIS18AQ9NYP9 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MIS18AQ9NYP9 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MIS18AQ9NYP9 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MIS18AQ9NYP9 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MIS18AQ9NYP9 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MIS18AQ9NYP9 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MIS18AQ9NYP9 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MIS18AQ9NYP9 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MIS18AQ9NYP9 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MIS18AQ9NYP9 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
MIS18AQ9NYP9 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MIS18AQ9NYP9 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MIS18AQ9NYP9 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MIS18AQ9NYP9 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MIS18AQ9NYP9 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MIS18AQ9NYP9 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
MIS18AQ9NYP9 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MIS18AQ9NYP9 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MIS18AQ9NYP9 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MIS18AQ9NYP9 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MIS18AQ9NYP9 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MIS18AQ9NYP9 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MIS18AQ9NYP9 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MIS18AQ9NYP9 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MIS18AQ9NYP9 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MIS18AQ9NYP9 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MIS18AQ9NYP9 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MIS18AQ9NYP9 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MIS18AQ9NYP9 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MIS18AQ9NYP9 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MIS18AQ9NYP9 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MIS18AQ9NYP9 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MIS18AQ9NYP9 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MIS18AQ9NYP9 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MIS18AQ9NYP9 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MIS18AQ9NYP9 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MIS18AQ9NYP9 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MIS18AQ9NYP9 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MIS18AQ9NYP9 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MIS18AQ9NYP9 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MIS18AQ9NYP9 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MIS18AQ9NYP9 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MIS18AQ9NYP9 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MIS18AQ9NYP9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MIS18AQ9NYP9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MIS18AQ9NYP9 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MIS18AQ9NYP9 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MIS18AQ9NYP9 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MIS18AQ9NYP9 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MIS18AQ9NYP9 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MIS18AQ9NYP9 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
MIS18AQ9NYP9 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
MIS18AQ9NYP9 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MIS18AQ9NYP9 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MIS18AQ9NYP9 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MIS18AQ9NYP9 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
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