Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY46

SCN3A, Sodium channel protein type 3 subunit alpha, humanhuman

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Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN3AQ9NY46 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN3AQ9NY46 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN3AQ9NY46 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN3AQ9NY46 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN3AQ9NY46 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN3AQ9NY46 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN3AQ9NY46 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN3AQ9NY46 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN3AQ9NY46 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN3AQ9NY46 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN3AQ9NY46 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN3AQ9NY46 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN3AQ9NY46 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN3AQ9NY46 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN3AQ9NY46 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN3AQ9NY46 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN3AQ9NY46 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN3AQ9NY46 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN3AQ9NY46 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN3AQ9NY46 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN3AQ9NY46 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN3AQ9NY46 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN3AQ9NY46 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN3AQ9NY46 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN3AQ9NY46 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN3AQ9NY46 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN3AQ9NY46 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN3AQ9NY46 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN3AQ9NY46 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN3AQ9NY46 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN3AQ9NY46 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN3AQ9NY46 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN3AQ9NY46 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN3AQ9NY46 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN3AQ9NY46 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN3AQ9NY46 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN3AQ9NY46 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN3AQ9NY46 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN3AQ9NY46 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN3AQ9NY46 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN3AQ9NY46 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN3AQ9NY46 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN3AQ9NY46 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN3AQ9NY46 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN3AQ9NY46 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN3AQ9NY46 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN3AQ9NY46 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN3AQ9NY46 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN3AQ9NY46 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN3AQ9NY46 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN3AQ9NY46 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN3AQ9NY46 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN3AQ9NY46 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN3AQ9NY46 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN3AQ9NY46 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN3AQ9NY46 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN3AQ9NY46 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN3AQ9NY46 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN3AQ9NY46 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN3AQ9NY46 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN3AQ9NY46 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN3AQ9NY46 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN3AQ9NY46 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN3AQ9NY46 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN3AQ9NY46 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN3AQ9NY46 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN3AQ9NY46 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN3AQ9NY46 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN3AQ9NY46 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN3AQ9NY46 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN3AQ9NY46 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN3AQ9NY46 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN3AQ9NY46 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN3AQ9NY46 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN3AQ9NY46 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN3AQ9NY46 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN3AQ9NY46 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN3AQ9NY46 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN3AQ9NY46 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN3AQ9NY46 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN3AQ9NY46 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN3AQ9NY46 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN3AQ9NY46 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN3AQ9NY46 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN3AQ9NY46 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN3AQ9NY46 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN3AQ9NY46 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN3AQ9NY46 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN3AQ9NY46 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN3AQ9NY46 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN3AQ9NY46 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN3AQ9NY46 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN3AQ9NY46 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN3AQ9NY46 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN3AQ9NY46 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN3AQ9NY46 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN3AQ9NY46 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN3AQ9NY46 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN3AQ9NY46 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN3AQ9NY46 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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