Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms