Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms