Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD8

DUOX2, Dual oxidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX2Q9NRD8 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DUOX2Q9NRD8 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DUOX2Q9NRD8 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DUOX2Q9NRD8 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DUOX2Q9NRD8 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
DUOX2Q9NRD8 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DUOX2Q9NRD8 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
DUOX2Q9NRD8 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
DUOX2Q9NRD8 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
DUOX2Q9NRD8 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DUOX2Q9NRD8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DUOX2Q9NRD8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DUOX2Q9NRD8 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DUOX2Q9NRD8 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DUOX2Q9NRD8 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DUOX2Q9NRD8 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DUOX2Q9NRD8 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DUOX2Q9NRD8 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DUOX2Q9NRD8 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DUOX2Q9NRD8 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DUOX2Q9NRD8 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DUOX2Q9NRD8 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DUOX2Q9NRD8 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DUOX2Q9NRD8 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DUOX2Q9NRD8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DUOX2Q9NRD8 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DUOX2Q9NRD8 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DUOX2Q9NRD8 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DUOX2Q9NRD8 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
DUOX2Q9NRD8 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DUOX2Q9NRD8 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DUOX2Q9NRD8 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DUOX2Q9NRD8 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
DUOX2Q9NRD8 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DUOX2Q9NRD8 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
DUOX2Q9NRD8 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
DUOX2Q9NRD8 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
DUOX2Q9NRD8 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
DUOX2Q9NRD8 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DUOX2Q9NRD8 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
DUOX2Q9NRD8 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
DUOX2Q9NRD8 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DUOX2Q9NRD8 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
DUOX2Q9NRD8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DUOX2Q9NRD8 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
DUOX2Q9NRD8 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DUOX2Q9NRD8 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
DUOX2Q9NRD8 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
DUOX2Q9NRD8 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
DUOX2Q9NRD8 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
DUOX2Q9NRD8 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
DUOX2Q9NRD8 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
DUOX2Q9NRD8 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
DUOX2Q9NRD8 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
DUOX2Q9NRD8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
DUOX2Q9NRD8 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
DUOX2Q9NRD8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
DUOX2Q9NRD8 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
DUOX2Q9NRD8 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
DUOX2Q9NRD8 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DUOX2Q9NRD8 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms