Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ76

MEPE, Matrix extracellular phosphoglycoprotein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEPEQ9NQ76 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MEPEQ9NQ76 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
MEPEQ9NQ76 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MEPEQ9NQ76 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
MEPEQ9NQ76 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MEPEQ9NQ76 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MEPEQ9NQ76 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MEPEQ9NQ76 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MEPEQ9NQ76 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MEPEQ9NQ76 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
MEPEQ9NQ76 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MEPEQ9NQ76 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms