Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB9BQ9NP90 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms