Protein–RNA interactions for Protein: Q9H875

PRKRIP1, PRKR-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1Q9H875 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRKRIP1Q9H875 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PRKRIP1Q9H875 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms