Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7C4

SYNC, Syncoilin, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCQ9H7C4 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SYNCQ9H7C4 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SYNCQ9H7C4 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SYNCQ9H7C4 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SYNCQ9H7C4 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYNCQ9H7C4 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYNCQ9H7C4 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYNCQ9H7C4 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYNCQ9H7C4 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYNCQ9H7C4 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SYNCQ9H7C4 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYNCQ9H7C4 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYNCQ9H7C4 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYNCQ9H7C4 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYNCQ9H7C4 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYNCQ9H7C4 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SYNCQ9H7C4 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYNCQ9H7C4 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SYNCQ9H7C4 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYNCQ9H7C4 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYNCQ9H7C4 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYNCQ9H7C4 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYNCQ9H7C4 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYNCQ9H7C4 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYNCQ9H7C4 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYNCQ9H7C4 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYNCQ9H7C4 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYNCQ9H7C4 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYNCQ9H7C4 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYNCQ9H7C4 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYNCQ9H7C4 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYNCQ9H7C4 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYNCQ9H7C4 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYNCQ9H7C4 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYNCQ9H7C4 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYNCQ9H7C4 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYNCQ9H7C4 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYNCQ9H7C4 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYNCQ9H7C4 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYNCQ9H7C4 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SYNCQ9H7C4 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYNCQ9H7C4 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYNCQ9H7C4 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYNCQ9H7C4 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYNCQ9H7C4 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYNCQ9H7C4 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SYNCQ9H7C4 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYNCQ9H7C4 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNCQ9H7C4 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNCQ9H7C4 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNCQ9H7C4 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNCQ9H7C4 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNCQ9H7C4 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNCQ9H7C4 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNCQ9H7C4 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNCQ9H7C4 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNCQ9H7C4 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNCQ9H7C4 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNCQ9H7C4 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNCQ9H7C4 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNCQ9H7C4 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNCQ9H7C4 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNCQ9H7C4 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNCQ9H7C4 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNCQ9H7C4 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNCQ9H7C4 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNCQ9H7C4 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNCQ9H7C4 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNCQ9H7C4 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNCQ9H7C4 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNCQ9H7C4 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNCQ9H7C4 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNCQ9H7C4 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNCQ9H7C4 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNCQ9H7C4 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNCQ9H7C4 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNCQ9H7C4 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNCQ9H7C4 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNCQ9H7C4 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNCQ9H7C4 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNCQ9H7C4 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNCQ9H7C4 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNCQ9H7C4 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNCQ9H7C4 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNCQ9H7C4 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNCQ9H7C4 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNCQ9H7C4 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNCQ9H7C4 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNCQ9H7C4 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNCQ9H7C4 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNCQ9H7C4 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNCQ9H7C4 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNCQ9H7C4 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNCQ9H7C4 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNCQ9H7C4 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYNCQ9H7C4 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYNCQ9H7C4 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYNCQ9H7C4 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYNCQ9H7C4 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYNCQ9H7C4 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms