Protein–RNA interactions for Protein: Q9H788

SH2D4A, SH2 domain-containing protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D4AQ9H788 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH2D4AQ9H788 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH2D4AQ9H788 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH2D4AQ9H788 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH2D4AQ9H788 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH2D4AQ9H788 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SH2D4AQ9H788 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH2D4AQ9H788 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH2D4AQ9H788 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH2D4AQ9H788 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH2D4AQ9H788 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH2D4AQ9H788 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH2D4AQ9H788 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH2D4AQ9H788 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH2D4AQ9H788 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH2D4AQ9H788 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH2D4AQ9H788 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH2D4AQ9H788 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH2D4AQ9H788 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SH2D4AQ9H788 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH2D4AQ9H788 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH2D4AQ9H788 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH2D4AQ9H788 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH2D4AQ9H788 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH2D4AQ9H788 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH2D4AQ9H788 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH2D4AQ9H788 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH2D4AQ9H788 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH2D4AQ9H788 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH2D4AQ9H788 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH2D4AQ9H788 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH2D4AQ9H788 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH2D4AQ9H788 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SH2D4AQ9H788 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH2D4AQ9H788 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH2D4AQ9H788 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH2D4AQ9H788 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH2D4AQ9H788 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH2D4AQ9H788 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH2D4AQ9H788 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH2D4AQ9H788 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH2D4AQ9H788 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH2D4AQ9H788 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH2D4AQ9H788 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH2D4AQ9H788 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH2D4AQ9H788 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH2D4AQ9H788 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH2D4AQ9H788 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH2D4AQ9H788 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH2D4AQ9H788 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH2D4AQ9H788 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH2D4AQ9H788 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH2D4AQ9H788 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH2D4AQ9H788 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH2D4AQ9H788 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH2D4AQ9H788 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH2D4AQ9H788 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH2D4AQ9H788 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH2D4AQ9H788 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH2D4AQ9H788 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH2D4AQ9H788 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH2D4AQ9H788 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SH2D4AQ9H788 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH2D4AQ9H788 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH2D4AQ9H788 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH2D4AQ9H788 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH2D4AQ9H788 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH2D4AQ9H788 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH2D4AQ9H788 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH2D4AQ9H788 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SH2D4AQ9H788 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH2D4AQ9H788 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH2D4AQ9H788 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH2D4AQ9H788 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH2D4AQ9H788 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH2D4AQ9H788 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH2D4AQ9H788 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH2D4AQ9H788 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH2D4AQ9H788 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH2D4AQ9H788 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH2D4AQ9H788 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH2D4AQ9H788 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH2D4AQ9H788 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH2D4AQ9H788 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH2D4AQ9H788 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH2D4AQ9H788 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH2D4AQ9H788 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH2D4AQ9H788 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH2D4AQ9H788 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SH2D4AQ9H788 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH2D4AQ9H788 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH2D4AQ9H788 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH2D4AQ9H788 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH2D4AQ9H788 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH2D4AQ9H788 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH2D4AQ9H788 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH2D4AQ9H788 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH2D4AQ9H788 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH2D4AQ9H788 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH2D4AQ9H788 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms