Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms