Protein–RNA interactions for Protein: Q9H094

NBPF3, Neuroblastoma breakpoint family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3Q9H094 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms