Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms