Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms