Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZI7

UPF3B, Regulator of nonsense transcripts 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF3BQ9BZI7 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms