Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GSDMCQ9BYG8 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GSDMCQ9BYG8 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GSDMCQ9BYG8 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GSDMCQ9BYG8 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GSDMCQ9BYG8 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GSDMCQ9BYG8 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
GSDMCQ9BYG8 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GSDMCQ9BYG8 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GSDMCQ9BYG8 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GSDMCQ9BYG8 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GSDMCQ9BYG8 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GSDMCQ9BYG8 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GSDMCQ9BYG8 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GSDMCQ9BYG8 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GSDMCQ9BYG8 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GSDMCQ9BYG8 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GSDMCQ9BYG8 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GSDMCQ9BYG8 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GSDMCQ9BYG8 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GSDMCQ9BYG8 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GSDMCQ9BYG8 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms