Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PACSIN1Q9BY11 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms