Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB11FIP5Q9BXF6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms